养殖污水如果处理不好，不仅仅会影响养殖品种的正常生长，还会对池塘造成很大的二次污染。目前而言，养殖污水处理已经不算是很难的一个污水处理工程。

现阶段国内的养殖污水处理一般都是采用格栅去除大块悬浮物，然后气浮去除微小型悬浮物，再经过厌氧+好氧生化处理，最后进行沉淀过滤消毒等深度处理，最终达标排放。也有利用厌氧过程中产生的沼气来利用新能源，以及最后的污泥做生物肥料。

针对养殖尾水的方法有物理处理法和化学处理法：

物理处理法通过利用各种孔径大小不同的额滤材，阻隔或吸附水中杂质，以保持水质洁净，目前以机械过滤和泡沫分离处理技术效果尤为明显，在工厂化规模养殖的尾水处理中获得广泛应用。

化学处理法是利用臭氧氧化水产养殖尾水中积累的氨氮、亚硝酸盐，降低有机碳含量、化学需氧量浓度，去除尾水中多种还原性污染物，起到净化水质，优化水产养殖环境作用，另外，水产养殖中使用次氯酸钙、生石灰等化学药剂作为水质改良剂，对尾水处理后，可提高水产养殖尾水排放的质量，但长期连续使用容易使菌株产生耐药性，对水产养殖环境造成二次污染。

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