吡蚜酮废水作为高浓度有机废水，同时也是农药废水之一。其采用的处理方法，主要是以生物法处理为主，物化法作为生化前的预处理。由于吡蚜酮废水的特性，进行生物处理时，不宜直接进行，需要先进行一定的预处理，再进行生物处理。这个也是常规高浓度有机废水处理方法

经过物化预处理的吡蚜酮废水，将悬浮物质和难降解的物质进行有效去除。后面就正式进入吡蚜酮废水生物处理。而吡蚜酮废水生物处理方法采用的不是单一的生物处理，而是采用厌氧-好氧组合处理工艺。原因是，单一的生物处理法无法达到排放标准。而组合处理工艺是有效将吡蚜酮废水的COD、BOD等去除外，还能在工艺中增加缺氧池，对废水起到脱氮除磷的效果，这个也是现今对废水排放作出的新的标准。

常规的农药废水生物处理方法有AB活性污泥法、SBR法、MBR工艺、生物滤池等。

而吡蚜酮废水与传统的农药废水是有一些差异的，采用传统的生物处理方法，会产生建筑面积较大，成本增加，后期维护较复杂等缺点。为了使得整个吡蚜酮废水处理方法能达到预期的效果，并且，满足吡蚜酮生产厂家的要求。在传统的农药废水生物处理方法中进行改进，采用更为先进有效的方法，如A2/O法（在AB活性污泥法中改进而来）、CASS法（在SBR法演变而来）、曝气生物滤池等等。具体需要根据成本预算。厂家需求等选择不同的生物处理方法。

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