发酵类制药废水污染源主要来自菌渣的分离，药物的提取、精制、溶剂的回收及设备、地面冲洗水等产生过程。此类废水的处理难度与其他制药废水处理相比相对较高。发酵类抗生素生产废水污染物浓度高、水量大，废水中所含成分主要为发酵残留物、破乳剂和残留抗生素及其降解物，还有抗生素提取过程中残留的各种有机溶剂和一些无机盐类等。其废水成分复杂，碳氮营养比例失调（氮源过剩），硫酸盐、悬浮物含量高，废水带有较重的颜色和气味，易产生泡沫，含有难降解物质、抑菌作用的抗生素并且有毒性等，而致生化降解困难。其特点归纳为以下几点：
1、排水点多，高、低浓度废水若单独处理，有利于清污分流，分类处理。
2、高浓度废水间歇排放，酸碱性及温度变化较大，需要较大的收集调节装置。
3、废水的COD浓度高，一般含量为10000mg/L以上，主要为发酵残余基质及营养物、溶剂提取过程的萃取余液、蒸馏釜残留液、离子交换过程中排出的吸附废液、发酵过滤液及染菌倒罐废液等。
4、炭氮比低。发酵过程中满足发酵微生物新陈代谢过程的需要，一般控制发酵的C/N 为4：1，这样废发酵液中的BOD/N一般在1-4，与废水处理微生物的营养要求相差甚远，严重影响微生物的生长与代谢，不利于提高废水生物处理的负荷及效率。
5、氮含量高、悬浮物浓度高。
6、废水中含有微生物难以降解甚至对微生物有抑制作用的物质。
根据发酵类制药废水的特性，漓源环保对该类废水的治理主要采用预处理-厌氧（或水解酸化）-好氧组合生化处理工艺，即高浓度废水先经预处理、厌氧生化处理，出水再与低浓度废水混合进行好氧生化（或水解-好氧生化）处理；或者高浓度废水先与其他废水混合，然后采用预处理、好氧生化处理的流程。
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