在含磷工业污水处理工程中，首先需要明确的是，一个好的生物除磷系统有好的排泥措施及方案，特别是含磷工业污水处理的这类含磷占比相当高的废水。为什么会提出这个问题，主要是发现很多人对生物除磷工艺的机理并不了解，甚至还包括一些环保工作者，会对生化系统进行盲目设计和调试。
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在含磷工业污水处理工程中，磷的形态总共有三种：有机磷、无机磷和还原态PH3，水中主要是以前两者的形态出现。而生物除磷菌主要有三种：①聚合磷酸盐积累微生物（即聚磷菌PAO）；②反硝化除磷菌（DPB）；③磷酸盐还原菌。
PAO和DPB这两种微生物除磷的方式很相似，可以分为两个过程，第一个过程是PAO、DPB菌消耗自身的磷转成能量ATP来进行生物体活动，主要是进行摄食，这个时候PAO、DPB菌会吸取水中的小分子有机物，然后排出消耗能量之后产生的磷酸；第二个过程是过量吸磷，这个时候PAO菌以O2为电子受体，DPB菌以硝酸盐、亚硝酸盐为电子受体，从水中超量吸收磷酸盐转化为聚磷酸盐存在自己或新细胞体内；通过这两个过程产生了新细胞进行更新换代。因此，PAO、DPB菌除磷的机理是超量吸磷的过程，这个过程是将水中的液态磷转化为生物体内的固态磷，而排泥的目的就是在排多余的生物体，磷终随着排出的生物体从水体中分离出来，这就达到生物除磷、净化废水的目的。
磷酸盐还原菌是通过还原作用将废水中的P转化为还原态PH3，P以气体释放出来。目前使用成熟和广泛的主要还是以PAO、DPB菌为主，代表工艺是常用的A2/O以及A/O工艺，如果没有排泥措施，那么就意味着磷会在系统中积累，污泥龄过长，待污泥老化后发生磷的再次释放，这样生物除磷系统就失去了原本的意义，这就能解释在生化除磷过程中排泥的重要性。
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