活性污泥法是在工业污水处理中一种较常见的处理方法。在活性污泥法中初期吸附进入细胞体内的有机污染物，其中一部分在各种酶的作用下，经过一系列中间状态被微生物氧化分解为产物二氧化碳和水等稳定的无机物质，并从中获得合成新细胞物质所需的能量，我们称为分解代谢（异化作用），这一过程如下：
CxHyOz+（x+y/4-z/2）O2→酶→xCO2＋y/2H2O+能量 式中CxHyOz为有机物污染物
另一部分有机污染物质则被微生物利用合成新的细胞物质，是细胞增殖，即合成代谢（同化作用）。有机污染物＋氨气＋氧气＋能量→酶→微生物细胞组织物质的化学式＋二氧化碳＋水。
在曝气池的末端或者池内营养物质缺乏式，微生物可能进入内院代谢反应，即微生物对自身的细胞物质进行代谢反应，代谢产生的能量维持微生物的生命活动。
因此，微生物对污染物的代谢过程可分为同化作用和异化作用。同化作用产生新细胞体，新细胞体含有微生物净增殖部分和内源呼吸部分以及能量；其产生的能量继续为同化作用提供能量。异化作用产生能量和代谢产物。代谢产物包括，二氧化碳、水、氨气等等。
无论式分解代谢还是合成代谢，都能够去除污水中的有机污染物，但产物有所不同，分解代谢的产物主要还是二氧化碳和水，一般可直接排入环境；而合成代谢的产物是新生的微生物细胞和内源代谢的残渣，通常以剩余污泥的形式排除系统，对其应采用妥善处理，否则会造成二次污染。
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