在工业污水处理行业中，微生物种类繁多，如菌类、藻类、动物类等。常见的菌种培养，就是为微生物提供一定的营养物质，创造有利的环境，达到生长繁殖条件，从而利用微生物的新陈代谢，对污染物质进行转化的过程。可见菌种的培养与其代谢和生长环境有着莫大的关系。
细菌和真菌以废水中的有机物、磷、氮等作为营养物质，藻类则利用二氧化碳与氮、磷进行光合作用，原生动物和后生动物可将有机物、菌类、藻类等作为营养源，后生动物还可吞食原生动物。有了这些营养物质，微生物通过摄取营养，不断进行新陈代谢，细胞快速繁殖。不同微生物所需的营养比例不同，为达到理想的去除效果，需时长对水中的碳氮磷比进行监测与控制。
除了提供足够的营养，微生物的生长环境控制主要条件，pH值、溶解氧（DO）、温度、有毒有害物质等条件的控制也是不可忽略的因素。
pH值：pH值的保持对于微生物培养非常重要，控制不当容易造成死亡，大多数的细菌在中性环境下生存；
DO：DO是好氧微生物的主要控制因素，没有溶解氧，好氧微生物就不能生长繁殖，此外，厌氧微生物在DO过高的环境下也会造成不良影响；
温度：微生物总体温度范围在0～80℃之间，常见的有中温厌氧微生物20～45℃；好氧微生物20～37℃，在该温度范围内，保持较高的温度条件生物处理效果较好；
有毒有害物质：有毒有害物质会对微生物具有抑制和毒害作用，使细胞失去活性，其允许浓度应根据实验结果来确定。
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