以下制药废水处理的物化处理方法是根据化学合成类制药废水的特点和所需处理的目的进行分类。
1、高盐预处理工艺：一般无机盐高于5000mg/L的废水对生化有影响，可以采用蒸发进行脱盐，可分为单效蒸发脱盐法和多效蒸发脱盐法，近年来产生的MVR蒸发器就有效率高、能耗低的特点被广泛应用。
2、高浓度有机含量预处理工艺：化学合成类制药采用的有机溶剂多为不溶或微溶于水，微生物不能直接利用，常采用高级氧化法进行预处理，高级氧化法有多种，像铁碳微电解法、芬顿氧化法、臭氧氧化、湿式催化氧化法、电催化氧化法、光催化氧化法等，这些方法都可以将有机物质断裂、结构被分解，高分子的有机物经过分解后变成可溶于水的小分子有机物，可生化性自然而然就提高了，就可以被微生物轻易吸收，从而达到去除的目的。
3、重金属预处理工艺：重金属多具有有毒有害性质，进入生化系统会影响生物活性，对于重金属的去除，通常采用化学氧化还原法或者絮凝沉淀，控制pH值，添加针对性化学药品，将重金属沉淀下来达到去除的目的。化学处理法对重金属的去除可以达到99%以上。
4、高氨氮预处理工艺：对于氨氮的物化处理主要有空气吹脱法、折点加氯法、蒸汽气提法，这些方法去除效果虽然很有效，但是成本高。
5、高磷预处理工艺：主要是采用化学除磷法，将磷转化为不溶性磷酸盐，经沉淀去除。
6、高硫预处理工艺：高浓度的硫酸盐会对生化厌氧处理的产生影响，会降低厌氧产甲烷量，同时产生大量的硫化氢、硫醚等恶臭气体，不仅降低的甲烷纯度，还会影响周围环境，造成大气污染。硫酸盐可以通过蒸发脱盐除去，也可以采用化学法形成沉淀去除，但是硫同时具有还原性和氧化性，反应控制要严格，否则也会产生危害气体。
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