厌氧生物处理技术作为漓源环保的核心技术之一在实际工业污水处理中应用广泛。在废水的厌氧处理过程中，大分子有机物通过水中甲烷菌和非甲烷菌的共同作用，转化为甲烷、二氧化碳、水、硫化氢和氨等物质。复杂有机物的厌氧降解过程大致可分为三个阶段。
水解与发酵阶段:在这一阶段废水中的发酵细菌将高分子有机物水解为可溶性的小分子物质，进而通过发酵作用转化成挥发性脂肪酸、醇类、乳酸、二氧化碳、氢气、氨、硫化氢等物质。
产氢产乙酸阶段:上个阶段产生的挥发性脂肪酸、醇类、乳酸等在这一阶段通过酸化细菌的作用，发生酸化反应转化为乙酸、氢气、碳酸以及新的细胞物质。
产甲烷阶段:作为厌氧反应的第三阶段，产甲烷菌将乙酸、氢气、碳酸、甲酸和甲醇等转化为甲烷、二氧化碳和新的细胞物质。
水解与发酵阶段，作为厌氧生物处理的首先阶段，废水中的复杂有机物首先经过微生物细菌胞外酶的水解作用分解为简单的溶解性的小分子物质，使之更易被细菌体吸收利用。在反应过程中，细菌胞外酶是否可以有效接触底物是整个过程的关键，而微生物的水解作用较为缓慢，所以高分子有机物的水解过程往往被视为整个厌氧生物过程中的限速阶段。影响水解速度及其程度的因素有多方面。
发酵过程是继水解作用后，发酵细菌将水解阶段产生的可溶性物质转化为更为简单的以挥发性脂肪酸为主的末端产物。其中，对于一些有机物(包括碳水化合物、蛋白质、有机酸)较高的废水，起主要作用的是拟杆菌，而对于一些有毒有害废水，其中起主要作用的是梭状芽抱杆菌。起发酵作用的细菌绝大部分为严格厌氧菌，只有不到1%的兼性厌氧菌可能存在于厌氧环境中，兼性厌氧菌的存在可以避免产甲烷细菌受到外在的氧的损害从而抑制产甲烷菌的活性。
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