在印染工业污水处理中以生物治理为主、化学治理为辅、生物处理技术和物理化学处理技术相结合的综合治理路线，不宜采用单一的物理化学处理单元作为稳定达标排放治理流程。因为生物治理需连续运行，否则不能满足达标要求。而对时开时停的单一化学治理路线不予采用和推荐。
由于印染废水的多变性，生物法处理效果有时还不能达到十分满意的效果。
因此，开发适应能力强的菌种，提高生物法的处理效果，并使废水经过处理后达到回用的要求，将是今后生物法研究的主要目标。
新型的生物制剂有以下几种：
(1)酶制剂：利用生物酶制剂处理废水、净化环境比其他生物法效率高、速度快、出水好，不产生二次污染。用于印染废水处理的酶有漆酶、木质素过氧化物酶、嗜碱酶等。
在木质素等过氧化物酶存在的条件下，漆酶的色度去除率可提高到75％。
(2)废水脱色微生物制剂：将污水处理厂活性污泥中的微生物进行分离纯化，来提取对染料脱色效果好的微生物，并进行培养。活性污泥中微生物种类较丰富，包含有细菌、真菌、微型动物等不同门类的生物物种，活性污泥中的微生物形成一个生态系统，在这个系统中以自养型微生物为主。
细菌吸食环境十的有机物，而细菌又会成为某些原士动物或后儿动物的食饵，原生动物之叫还有互相捕食，不同的后生动物也可能处在不同的营养层次上多种类的微牛物形成一个复杂的食物网。
中同科学院微生物研究所分离出的5种高效细菌对酸性红B2GL、酸性媒介棕RH、酸性媒介蓝B和酸性媒介黄GG等染料具有脱色降解能力，在细菌隔膜接种厌氧菌或好氧菌种系统中，处理模拟染色废水，脱色率能达到85％以上。
微生物所和中国纺织工业设计院等单位分离出数百株脱色菌，将脱色卤和PVA降解菌投加到废水处理池中，脱色率达80％，PVA去除率达75％一90％，远高于普通。
(3)士物絮凝剂：与无机和有机合成高分子絮凝剂相比，生物絮凝剂具有许多独特的性质和优点：
①易于固液分离，形成沉淀物少；
②易被土物降解，无毒无害，安全性高；
③无二次污染；
④适应范围广；
⑤具有除浊和脱色性能等；
⑥有的生物絮凝剂还具有不受pH值条件影响，热稳定性强，用量少等特点。
人们预见生物絮凝剂絮凝活性的广性将使彻底消除污染成为现实，它大部分或全部取代合成高分子絮凝剂址大势所趋。
现在用于印染废水处理的生物絮凝剂有PFIOI(用于处理含羧甲基纤维素的退浆废水)、MF一3和NA7(用于染液脱色)和NOC一1(可消除污泥膨胀。恢复活性污泥的沉降性能)。
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