一、医药废水的来源
生物法对制药废水处理的废水可分为提取废水、洗涤废水和其他废水。废水中污染物的主要成分是发醉残余的营养物，如糖类、蛋白质、脂类和无机盐类(Ca2+、Mg2+，K+，Na+，SO42-，HPO42-，Cl-，C2O4等)，其中包括酸、碱、有机溶剂和化工原料等。
1、提取废水
提取废水是经提取有用物质后的发酵液，所以有时也叫发酵废水。含大量未被利用的有机组分及其分解产物，为该类废水的主要污染源。另外，在发酵过程中由于工艺需要采用一些化工原料，废水中也含有一定的酸、碱和有机溶剂等。
2、洗涤废水
洗涤废水来源于发酵罐的清洗、分离机的清洗及其它清洗工段和洗地面等，水质一般与提取废水(发酵残液)相似，但浓度较低。
3、其他废水
生物制药厂大多有冷却水排放。一般污染段浓度不大，可直接排放，但可好回用。有些药厂还有酸、碱废水，经简单中和可达标排放。在生物制药废水中，维生素C生产废水有机污染也十分严重，综合废水的COD含量可达为8000～10000mg/L，含甲醇、乙醇、甲酸、蛋白质、古龙酸、磷酸盐等物质，废水偏酸性。
二、医药废水处理工艺设计原则
为确保医药废水处理站能够充分发挥其环境效益，做到可持续运行。通过合理的工艺设计与优化，达到既实现其环境效益，又充分实现经济上的合理性。基于该种思路，确立了如下设计原则：（1）确保处理出水达到当地环保部门的要求。（2）通过合理的设计降低一次性投资。（3）使医药废水处理站可持续运行，优化日常运行费用。
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