制药废水中的盐类主要为氯化钙、氯化铵、氯化钠等氯盐，制药废水本身可生化性较差，水中大量的氯离子不仅对微生物的生存生长具有抑制作用，对废水处理过程中所接触的金属物质、混凝土结构均会造成腐蚀，因此，如何解决制药废水处理中废水的盐分累积的问题迫在眉睫。
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制药废水中的盐类主要来源于发酵及抗生素类药物的生产过程，这类废水通常带有一些未反应的制药原料和合成此材料中间体，因此，要控制制药废水中的盐类累积，首先要从废水的源头抓起，采取对原料与中间体进行回收或再利用、使用更环保的工艺等，都是能够有效降低废水盐分的好方法。另外，引入生活污水对高盐废水进行稀释也是一种有效措施，降低水中含盐量能够使微生物更好更快的适应废水。
漓源环保承接的某抗生素制药废水处理工程，废水含盐量为1%左右，属于低生化性高盐废水，通过采用“催化微电解→漓源高效水解酸化反应器→多级接触生化反应池”处理工艺，催化微电解能够提高废水的可生化性，生化段微生物采用经驯化的耐盐型微生物，处理后废水可达到广东省地方一级排放标准，至目前已稳定运行两年。该抗生素制药废水处理工程中采用的结构均为防氯离子腐蚀性能强的材料，因此能够抵御高盐废水中氯离子对设备材料的腐蚀，该工艺具有相比蒸发、电解、电渗析等常见的脱盐处理工艺成本更低、运行成本更省、操作更简单的优点。
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