畜牧兽医制药产品与人用基本相同，其生产废水污染物性质也大致相同，主要差别体现在于畜牧兽医制药的生产工艺上。
根据畜牧兽医制药的生产情况，其排放废水有以下几种：
1、化学合成药物生产废水。化学合成药物废水主要来源于工艺废液及清洗用水，其水质根据其使用的原材料而变化，成分复杂，COD浓度高；
2、生物制药废水。如畜牧兽医制药常用的各类抗生素，其生产废水COD浓度中高，残留的抗生素对微生物具有抑制作用，可生化性差；
3、中草药类废水。这类废水的成分主要为天然存在的物质，主要污染物指标为COD、SS、色度等。
畜牧兽医制药废水一般浓度高，不低于2000mg/L，水量水质波动大，废水中的污染物多属于结构复杂、有毒害、难降解的有机物，有明显的酸碱性，部分废水含盐量高，属于较难处理的工业废水。
畜牧兽药废水处理一般有物理法、生化法、化学法和物化法，各种方法用于针对畜牧兽药不同生产工艺上的废水，在实际工程中，常需采用多种方法和技术组合处理。由于畜牧兽药涉及范围较广，其详细介绍可根据制药工艺见我司其它制药污水处理介绍，下面对以上四种基本方法对畜牧兽药的处理做简要说明：
1、物理法：常见的如筛滤截留法、重力分离法等，用于对废水的调节、隔油、过滤等。其原理简单，操作方便，普遍用于畜牧兽医废水的预处理；
2、生化法：生化法畜牧兽医制药废水处理的核心，生化处理有机污染物去除率高，成本低、操作管理方便，去除效果稳定；
3、化学法：化学处理法用于去除畜牧兽药废水中有毒物质及一些难降解的污染物，其反应迅速，去除效果强，但处理成大大，且容易产生大量污泥甚至是二次污染，因此一般作为生化前处理或深度处理；
4、物化法：常见的物化法有混凝沉淀法、气浮法、膜分离法等。典型的混凝沉淀法常用于畜牧兽医废水的预处理中。
