中药制药主要是以中药材为原料生产的中药饮片或中成药产品，原料均为天然存在的物质，其结构不经过化学修饰或人工合成。废水中的COD、悬浮物、色度是其主要的污染物指标。
中药饮片废水主要来源于药材的清洗与炮制过程，而中成药废水除上述工艺外，在煮提、干燥、制剂过程中亦产生大量的废水。产生废水具有以下特点：
（1）洗药废水：中药制药废水几乎有一半来源于药材的清洗，废水浓度相对较低，主要污染物质有悬浮物、动植物油等；
（2）煮提废水：有机物主要来源于中药材的提取过程，而煮提废水绝大部分水分以水蒸气形式排放，水量相对较小；
（3）清洗废水：主要由清洗设备废水、清洗容器和地面冲洗废水组成。
1、有机物浓度高，属于中高浓度废水，含有纤维素、木质素及其它复杂有机物；
2、含盐量高，可生化性差，部分种类的制药废水具有毒性；
3、废水中含有硫化物及各类挥发性有机物，易散发恶臭；
4、废水色度及悬浮物较高，主要是泥沙、动植物碎片、微细颗粒、胶体等；
5、中成药废水来水温度较高。
中药制药废水主要有物化法、生化法及其组合工艺。
物化法多采用混凝沉淀法、气浮法或铁碳微电解法，主要应用于中药制药废水的前处理，以降低废水的悬浮物及色度。但物化法运行成本高、操作强度大，且会产生大量的污泥，因此中药制药污水处理应以生化法为主。
生化法主要有水解酸化、厌氧法、好氧法等处理工艺，当废水浓度较低时，一般采用水解酸化+好氧法进行处理，而厌氧法+好氧法适用于污染物浓度较高的中药制药废水。
